VASP 固定晶胞方向不优化

在优化表面,二维或一维体系时,必须固定某个或某几个晶胞方向不优化。VASP本身没有这个功能,但是提供了 constr_cell_relax.F 文件来设置。根据文件中的提示,添加几

建站历程及心得

早在上高中的时候,家里购买了第一台电脑,并且可以上网,我便各种搜集网络资源,阅读各类书籍,做读书笔记,在网易博客上写心得分享。 上班后,随着工

如何在ARM平台编译NAMD

简介

NAMD是一种平行分子动力学代码,设计用于大型生物分子系统的高性能模拟。 利用Charm ++并行编程框架,NAMD可以扩展到几个核心,用于典型的仿真,超过500,000个核心,用于最大的仿真。

使用此系统编写的程序在具有或不具有共享内存的MIMD计算机上运行不变。 它提供了高级机制和策略,以促进开发甚至高度复杂的并行应用程序的任务。

ANGSD 编译安装教程

简介

ANGSD: Analysis of next generation Sequencing Data 下一代测序数据的分析

ANGSD是一种用于分析下一代测序数据的软件。 该软件可以处理从映射读数到推算基因型概率的许多不同输入类型。 大多数方法都考虑了基因型不确定性,而不是基于被称为基因型的分析。 这对于低深度和中深度数据尤其有用。 该软件是用C++编写的,并且已经用于大样本量。